Un tiers des personnes souffrant d’un trouble anxieux ne répond pas aux traitements conventionnels. La stimulation magnétique transcrânienne répétitive (SMTr) pourrait être un traitement complémentaire ou alternatif pour tenter de soigner ces personnes. Dans cet article, nous décrivons l’état des connaissances actuelles dans ce domaine de recherche émergeant concernant l’efficacité du traitement de la SMTr pour traiter certains troubles anxieux (selon le DSM-IV-TR). Le trouble de stress post-traumatique, le trouble obsessionnel-compulsif et le trouble panique sont les troubles anxieux les plus étudiés en lien avec la SMTr. De façon générale, les résultats montrent que la SMTr pourrait être efficace, mais à certaines conditions. Nous identifions les conditions d’efficacité, incluant les paramètres critiques utilisés dans le traitement par la SMTr. Nous identifions aussi les limites des études réalisées à ce jour et les pistes de recherche prometteuses pour la suite.